এনএসএআইডি (NSAID) জনিত আলসার প্রতিরোধে ব্যবহারের ক্ষেত্রে গ্যাস্ট্রোইনটেস্টাইনাল পার্শ্বপ্রতিক্রিয়া কমাতে মিসোপ্রোস্টল খাবারের সাথে এবং ঘুমানোর আগে মুখে সেবন করুন। গর্ভাবস্থা সমাপ্তি বা প্রসব বেদনা শুরু করাসহ প্রসূতি ও স্ত্রীরোগ সংক্রান্ত নির্দেশনার ক্ষেত্রে ক্লিনিকাল প্রোটোকল এবং গর্ভকালীন সময়ের উপর ভিত্তি করে গাল (buccal), জিহ্বার নিচে (sublingual) বা যোনিপথে ব্যবহারের পরামর্শ দেওয়া হয়। গাল বা বাক্কাল ব্যবহারের ক্ষেত্রে অবশিষ্ট অংশ গিলে ফেলার আগে ৩০ মিনিট গাল ও মাড়ির মাঝখানে ট্যাবলেটটি রাখুন। জিহ্বার নিচে ব্যবহারের ক্ষেত্রে ট্যাবলেটটি ৩০ মিনিটের জন্য জিহ্বার নিচে রাখুন। বয়স্ক রোগী বা যাদের বৃক্কের সমস্যা রয়েছে তাদের জন্য সাধারণত ডোজ সমন্বয়ের প্রয়োজন হয় না, তবে ড্রাগের অর্ধ-জীবন (half-life) দীর্ঘায়িত হতে পারে বলে সতর্কতা অবলম্বন করা উচিত। গর্ভবতী মহিলাদের আলসার প্রতিরোধের জন্য মিসোপ্রোস্টল কঠোরভাবে নিষিদ্ধ, কারণ এটি গর্ভপাত ঘটাতে পারে এবং জরায়ু ফেটে যাওয়ার ঝুঁকি তৈরি করে।