পলিমিক্সিন বি ইন্ট্রাভেনাস ইনফিউশন, ইন্ট্রামাসকুলার ইনজেকশন বা ইন্ট্রাথেকাল ইনজেকশনের মাধ্যমে প্রয়োগ করা হয়। ইন্ট্রাভেনাস ব্যবহারের জন্য, এটি অবশ্যই ৫% ডেক্সট্রোজ ইনজেকশনে মিশ্রিত করতে হবে এবং অবিচ্ছিন্ন ইনফিউশন হিসেবে প্রয়োগ করতে হবে। ইন্ট্রামাসকুলার ইনজেকশন অত্যন্ত বেদনাদায়ক এবং সাধারণত প্রয়োজন না হলে সুপারিশ করা হয় না। বৃক্কের বা কিডনির কার্যকারিতার ওপর ভিত্তি করে ডোজ সমন্বয় করা জরুরি, কারণ ওষুধটি অত্যন্ত নেফ্রোটক্সিক (কিডনির জন্য ক্ষতিকর)। হেপাটিক বা লিভারের ডোজ সমন্বয় স্পষ্টভাবে প্রয়োজন নেই। সতর্কতার মধ্যে নেফ্রোটক্সিসিটি এবং নিউরোটক্সিসিটির জন্য গুরুতর বক্সড ওয়ার্নিং অন্তর্ভুক্ত রয়েছে, যা মুখ ফ্যাকাশে হওয়া, মাথা ঘোরা, অ্যাটাক্সিয়া এবং গুরুতর নিউরোমাসকুলার ব্লকেড হিসেবে প্রকাশ পেতে পারে যা শ্বাসযন্ত্রের পক্ষাঘাতের দিকে পরিচালিত করতে পারে। অন্যান্য নেফ্রোটক্সিক বা নিউরোটক্সিক ওষুধের সাথে এর ব্যবহার এড়িয়ে চলতে হবে। এটি শিশুদের ক্ষেত্রে কঠোরভাবে ওজন-ভিত্তিক ডোজ দিয়ে ব্যবহার করা হয় এবং বয়স্ক রোগীদের ক্ষেত্রে বয়স-সম্পর্কিত কিডনিজনিত সমস্যার কারণে অত্যন্ত সতর্কতা এবং ডোজ কমানো প্রয়োজন।